近日，浙江農(nóng)林大學(xué)孫學(xué)鵬教授團(tuán)隊(duì)和安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)殷學(xué)仁教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合在國(guó)際著名期刊《Plant Communications》（中科院1區(qū)，IF=11.6）在線(xiàn)發(fā)表題為 “The haplotype-resolved genome assembly of the hexaploid kiwifruit Actinidia deliciosa reveals its hybrid origin and polysomic inheritance”（《六倍體美味獼猴桃單倍型基因組組裝揭示其雜交起源和多體遺傳》）的研究論文。該研究通過(guò)六倍體單倍型基因組的組裝，揭示了六倍體美味獼猴桃起源于約210萬(wàn)年前四倍體祖先（與中華獼猴桃親緣關(guān)系密切）和二倍體祖先（遺傳學(xué)特征類(lèi)似二倍體美味獼猴桃）的雜交事件，其基因組在多體遺傳作用下形成了統(tǒng)一的基因庫(kù)。
獼猴桃（獼猴桃屬）具有廣泛的倍性變異，自然群體中存在從二倍體、四倍體、六倍體直至更高倍性的多倍體物種。其中，美味獼猴桃（綠肉獼猴桃）為六倍體物種（2n=6x=174），而其近緣種中華獼猴桃（黃肉獼猴桃）則主要以二倍體（2n=2x=58）或四倍體形式存在。這種復(fù)雜的倍性多樣性反映了獼猴桃網(wǎng)狀進(jìn)化歷程，很可能是多個(gè)祖先譜系通過(guò)雜交和基因組加倍事件共同塑造的結(jié)果。因此，解析六倍體美味獼猴桃的起源與遺傳機(jī)制，對(duì)于理解多倍化如何進(jìn)化及指導(dǎo)育種具有重要意義。
本研究通過(guò)六倍體單倍型基因組的組裝，揭示了六倍體美味獼猴桃起源于約210萬(wàn)年前四倍體祖先（與中華獼猴桃親緣關(guān)系密切）和二倍體祖先（遺傳學(xué)特征類(lèi)似二倍體美味獼猴桃）的雜交事件，其基因組在多體遺傳作用下形成了統(tǒng)一的基因庫(kù)。盡管未發(fā)現(xiàn)明顯的亞基因組分化，但同源基因間存在輕度表達(dá)優(yōu)勢(shì)現(xiàn)象，這可能源于遺傳的表觀(guān)差異，如調(diào)控區(qū)域的DNA甲基化修飾。
該研究由浙江農(nóng)林大學(xué)李曉龍副教授與德國(guó)萊布尼茨淡水生態(tài)與內(nèi)陸漁業(yè)研究所Heiner Kuhl博士為論文共同第一作者，浙江農(nóng)林大學(xué)孫學(xué)鵬教授與安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)殷學(xué)仁教授為共同通訊作者。該研究得到了浙江省自然科學(xué)基金及“海外優(yōu)青”等項(xiàng)目資助。
（園藝學(xué)院 李曉龍 孫學(xué)鵬）
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